Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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