Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf4P43488 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms