Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

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Length 1,068 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pik3caP42337 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pik3caP42337 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pik3caP42337 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pik3caP42337 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pik3caP42337 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pik3caP42337 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pik3caP42337 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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