Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tnfsf9P41274 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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