Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2aP35436 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2aP35436 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin2aP35436 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2aP35436 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms