Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms