Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PvalbP32848 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PvalbP32848 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms