Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SsbP32067 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SsbP32067 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SsbP32067 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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