Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Saa4P31532 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms