Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PdgfraP26618 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms