Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd3eP22646 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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