Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou5f1P20263 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pou5f1P20263 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms