Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnnc1P19123 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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