Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sptan1P16546 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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