Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gabra6P16305 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms