Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms