Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1P12850 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms