Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb4P10284 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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