Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01655 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01655 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01655 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms