Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01649 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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P01649 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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P01649 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01649 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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