Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ifnb1P01575 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ifnb1P01575 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ifnb1P01575 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ifnb1P01575 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifnb1P01575 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms