Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Clk2O35491 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Clk2O35491 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Clk2O35491 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Clk2O35491 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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