Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Prrt1O35449 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms