Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MttpO08601 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MttpO08601 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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