Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp35M0QWN7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp35M0QWN7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms