Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm379J3QQ19 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Gm379J3QQ19 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
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