Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms