Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm5225J3QPL3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm5225J3QPL3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm5225J3QPL3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm5225J3QPL3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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