Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms