Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21976J3QNN2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gm21976J3QNN2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21976J3QNN2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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