Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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