Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn20G5E8X0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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