Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms