Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ScaperF8VQ70 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms