Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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