Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9972E9Q053 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms