Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms