Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms