Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms