Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kif28pD3YXS5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif28pD3YXS5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms