Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SafbD3YXK2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms