Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Phf11bB4XVQ1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Phf11bB4XVQ1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms