Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Clrn2B2RVW2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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