Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Brpf3B2KF05 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms