Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms