Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NhsB1AV60 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms