Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc163A2AGD7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc163A2AGD7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms