Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms