Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn9Q9Z0S7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn9Q9Z0S7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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