Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam50bQ9WTJ8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms